Kupmagere og soldater fra præsident Toures sikkerhedsstyrker var mandag aften i ildkamp i Malis hovedstad, Bamako.
Kampene har kostet flere liv, men der er ingen bekræftede tal på ofrene endnu.
Øjenvidner fortæller, at civile flygtede i lastbiler fra området omkring lufthavnen, hvor nogle af kampene fandt sted.
Der var også ildkampe ved en militærbase i Kali lidt uden for hovedstaden Bamako, som er hovedkvarter for oprørsleder Amadou Sanogos styrker.
Kampene aftog efter noget tid, og den afsatte præsident Amadou Toumani Toures sikkerhedsstyrker blev set forlade området.
En talsmand for juntaen siger, at ildkampen var et forsøg fra Toures styrkers side på at foretage et modkup.
- Det er elementer af præsidentgarden fra det gamle regime, og de prøver at vende tingene, siger talsmand Bacary Mariko.
- Vi har situationen under kontrol, tilføjer han.
Juntaen tog magten i Mali ved et militærkup 22. marts og sendte Amadou Toumani Toure på flugt ud af landet.
Kuppet er blevet mødt af international kritik. Det betragtes som et markant tilbageskridt for demokratiet i regionen.
Oprørerne sagde, at kuppet var nødvendigt på grund af regeringens manglende evne til at stoppe et tuaregoprør i den nordlige del af landet.
Militærjuntaen har dog ikke været i stand til at nedkæmpe oprørerne, og samtidig har både Den Afrikanske Union og den vestlige verden fordømt kuppet.
Den største tuareg-gruppe, Azawad National Liberation Movement (MNLA), har erklæret den nordlige del af landet for en selvstændig stat. En erklæring, som er afvist af det internationale samfund.
Samtidig er der tegn på, at islamister med forbindelser til al-Qaeda er ved at indføre en fundamentalistisk sharia-lovgivning og er ved at presse Tuareg-oprørerne ud af området.
Reuters/AFP