Nadal vandt sent søndag i tre sæt 7-5, 6-4, 6-4. Undervejs måtte den 23-årige spanier dog have behandling for en muskelskade i maven, men han overvandt smerterne og spillede videre.
Også 22-årige Andy Murray, der jagter sin første Grand Slam titel, er blandt de sidste 16 i US Open. Skotten besejrede den amerikanske wildcard-spiller Taylor Dent med cifrene 6-3, 6-2, 6-2.
Han møder nu den 16. seedede kroat, Marin Cilic.
På kvindesiden slog Kim Clijsters amerikanske Venus Williams i en vanvittig kamp, hvor belgieren vandt første sæt 6-0, hvorefter hun tabte andet sæt med de samme cifre. I tredje sæt måtte den tredjeseedede amerikaner se sig slået 4-6.
I kvartfinalen møder Clijsters kinesiske Na Li.