Hver femte af de 46.000 ansatte i EU har nu en løn på over en million kroner om året.
Og 1.600 af dem har en løn, der er højere end den danske statsministers 1,4 millioner kroner om året.
Det skriver Politiken på baggrund af en gennemgang af nye løntal.
Finansminister Claus Hjort Frederiksen (V) kalder det respektløst og vil tage et opgør om de enorme EU-lønninger, når Danmark overtager formandskabet til næste år.
"Her under den finansielle krise bør kommissionen udvise rettidig omhu og begrænse lønstigningerne til de EU-ansatte," siger finansministeren til Politiken.
I Europa er lønningerne faldet med fem procent siden 2008 - men i EU-systemet er den samtidig vokset med fire procent.
I EU-kommissionen er der dog ikke forståelse for den danske forargelse.
"Alle medlemslande kunne i sin tid have nedlagt veto mod lønreglerne. Dertil kommer, at lønningerne er nødvendige, hvis EU skal tiltrække de bedste og bede dem om at flytte fra deres hjemland," siger Michael Mann, talsmand for kommissionens viceformand, Maros Sefcovic.
Venstres Eva Kjær Hansen, der er næstformand i Folketingets Europaudvalg, kalder EU-lønningerne for tankevækkende.
"Der har altid været diskussioner om lønningsniveauet i EU-systemet. Og det er da også tankevækkende, at der sidder embedsfolk, der tjener mere end Danmarks statsminister," siger hun til Newspaq.
Lønreglerne har dog en klausul, der gør, at kommissionen under særlige omstændigheder kan sætte de EU-ansattes løn ned.
Danmark og de øvrige medlemslande har opfordret kommission til at anvende den klausul.